Molto prima della conquista castigliana, il sud di Tenerife era organizzato in menceyatos, i regni guanci in cui era divisa l'isola. Il territorio dell'attuale Granadilla faceva parte del menceyato di Abona, governato dal mencey Adjoña, che si estendeva su un ampio settore meridionale: le medianías e la costa di quelle che oggi sono Granadilla, San Miguel de Abona, Vilaflor, Arico e Fasnia. Quelle terre aride sostenevano una popolazione pastorale che sfruttava grotte, burroni e le scarse sorgenti. La tradizione lega inoltre questa comarca all'ultima resistenza indigena: per la sua condizione di ultimo baluardo di opposizione alla conquista, l'attuale villa avrebbe ricevuto secoli dopo il titolo di Villa Storica.

La colonizzazione europea articolò il popolamento intorno all'acqua. Verso il 1565 fu eretta l'eremo di Santa Lucía accanto alla cosiddetta Fuente del Lugar, e l'origine del nucleo è attribuita all'insediamento promosso dal colono portoghese Gonzalo González Zarco. Il toponimo Granadilla si consolidò dalla seconda metà del XVI secolo. Un episodio singolare segna la sua storia litoranea: il 1° ottobre 1519 la flotta di Fernando di Magellano fece scalo sulla sua costa all'inizio del primo giro del mondo, fatto che, insieme alla memoria della resistenza guanche, fonda il suo riconoscimento come Villa Storica conferito dal Governo delle Canarie nel 2010.

Il centro storico sorge nelle medianías, in un intreccio di vie lastricate, casoni canari con balconi e patii, antichi mulini e architettura popolare che evoca la villa agricola dei secoli dal XVII al XIX. Il suo monumento maggiore è la chiesa di San Antonio de Padua, originata da un primitivo eremo dell'ultimo terzo del XVI secolo, eretta a parrocchia nel 1617 e ricostruita in fasi successive; dichiarata Bene di Interesse Culturale, spicca per la sua torre dall'aria mudéjar e per la sua facciata barocca. Ad essa si aggiunge l'antico convento francescano di San Luis Obispo, fondato nel 1665 su richiesta della cittadinanza, devastato da un incendio nel 1745 e poi riabilitato, oggi recuperato come spazio culturale e di patrimonio religioso.

Per secoli l'economia fu eminentemente agricola e di sussistenza: cereali, patate, vigna e bestiame nelle medianías, insieme alla coltivazione della cocciniglia nel XIX secolo. Più tardi, l'irrigazione permise l'espansione del pomodoro e della banana da esportazione nella fascia costiera. La durezza del clima e l'emigrazione segnarono buona parte della sua storia contemporanea, finché la seconda metà del XX secolo aprì una stagione di profondo cambiamento.

Il litorale concentra oggi alcuni degli emblemi del comune. El Médano, la maggiore spiaggia naturale di Tenerife, crebbe da un umile borgo marinaro fino a diventare una località turistica dal marcato carattere sportivo. Accanto ad essa si erge la Montaña Roja, cono vulcanico protetto come Riserva Naturale Speciale, con saline e uccelli marini, che domina un arenile riconosciuto come una delle grandi mecche mondiali del windsurf e del kitesurf per la costanza degli alisei. In questo stesso tratto di costa, al termine della pista dell'aeroporto, si trova la Grotta del Santo Hermano Pedro: è bene chiarire che l'Hermano Pedro de San José de Betancur, primo santo canario, nacque a Vilaflor (comarca di Chasna) e non a Granadilla, ma fu in questa grotta che, secondo la tradizione, si rifugiò con il suo gregge durante i suoi anni da pastore, ciò che l'ha resa uno dei principali centri di devozione e pellegrinaggio dell'arcipelago.

La modernizzazione arrivò con l'autostrada del Sud (1971) e, soprattutto, con l'inaugurazione dell'Aeroporto di Tenerife Sud-Reina Sofía il 6 novembre 1978, oggi la principale porta aerea dell'isola con diversi milioni di passeggeri all'anno. A ciò si aggiunse lo sviluppo del Polo Industriale di Granadilla, uno dei grandi motori logistici e industriali del sud, e la scommessa sull'innovazione con strutture come l'ITER. Tutto questo ha fatto di Granadilla de Abona uno dei comuni più dinamici e popolati di Tenerife, con circa 59.000 abitanti, che combina un centro storico di medianías carico di patrimonio con nuclei costieri fiorenti come El Médano e San Isidro.