Mucho antes de la conquista castellana, las tierras que hoy forman Fasnia estaban habitadas por los guanches, que dejaron su huella en cuevas de habitación y enterramiento y en yacimientos de los barrancos de Herques y de Los Muertos. El municipio se asienta en una zona de frontera entre los antiguos menceyatos del sureste: algunas fuentes lo vinculan al reino o menceyato de Abona, mientras otras lo sitúan en el de Güímar, gobernado por el mencey Acaymo. Documentos del siglo XVI recogen el topónimo "Fasna" o "Fasnia", de probable raíz aborigen, y describen una comarca árida que los colonos castellanos apenas codiciaron, prefiriendo asentarse en la fértil Güímar, de la que estos pagos dependieron civil y religiosamente durante mucho tiempo.

La configuración administrativa de Fasnia fue lenta y compleja. En el primer tercio del siglo XVIII el caserío de Fasnia y pagos vecinos como La Zarza, Sombrera, Sabina Alta o Valencia quedaron vinculados a Arico, segregándose de la jurisdicción de Güímar. En 1795 Fasnia se separó de Arico para constituirse con sus límites modernos, y poco después, hacia 1796, la antigua ermita de San Joaquín obtuvo rango de parroquia. Con la implantación de los ayuntamientos constitucionales a comienzos del siglo XIX quedó configurado el municipio tal como lo conocemos, extendido por algo más de 45 km² desde las cumbres de la Corona Forestal hasta el mar.

La vida de Fasnia se forjó en las medianías, donde la economía tradicional combinó agricultura y ganadería en un medio de marcada aridez. Sobre extensos bancales de piedra volcánica se cultivaron trigo y cebada, papas, viña, higueras y, en distintas épocas, productos para la exportación como la cochinilla, el vino o, ya en el siglo XX, el tomate y la flor cortada. La cría de cabras y ovejas, el aprovechamiento del monte y oficios como el tejido de lienzos completaban una economía de subsistencia. La falta de agua fue el gran condicionante histórico, hasta que en el primer tercio del siglo XX la perforación de galerías —impulsada por vecinos como Juan González Cruz a partir de 1934— alumbró caudales que llegaron a abastecer incluso a municipios cercanos.

La historia de Fasnia está marcada por el fuego de la tierra. Entre finales de 1704 y la primavera de 1705 el sureste de Tenerife vivió una erupción múltiple en fisura que abrió tres focos escalonados: el volcán de Siete Fuentes (Arico) el 31 de diciembre de 1704, el volcán de Fasnia el 5 de enero de 1705 y, por último, el de Arafo el 2 de febrero, que se prolongó hasta el 27 de marzo. El volcán de Fasnia surgió hacia los 2.200 metros de altitud, en la vertiente oriental del dorso de Las Cañadas, a lo largo de una fisura con una treintena de bocas, y estuvo activo unos diez días. Sus coladas se encauzaron por las depresiones del terreno y apenas dañaron las tierras de labor, aunque la intensa actividad sísmica de aquel proceso causó derrumbes y, en el conjunto del fenómeno, la muerte de al menos dieciséis personas en la isla.

El patrimonio religioso resume bien esta trayectoria. La actual iglesia matriz de San Joaquín preside el casco y heredó la condición parroquial de la primitiva ermita de San Joaquín, hoy conocida como la Iglesia Vieja, levantada a mediados del siglo XVII con piedra tosca y madera de un pino centenario. Aquella ermita fue durante generaciones el corazón del pueblo —sede parroquial, lugar de reunión del concejo y cementerio provisional— hasta que, en torno a 1800, el culto se trasladó al nuevo templo y el viejo edificio cayó en desuso. De él perdura un esbelto arco de medio punto en cantería del siglo XVIII, convertido en símbolo del municipio.

Hoy Fasnia es un municipio pequeño y tranquilo de algo menos de 3.000 habitantes que conserva su carácter rural y agrícola. Su costa, con la playa y los roques de Fasnia, los charcos naturales y enclaves como Las Eras o El Abrigo, atrae a quienes buscan un litoral auténtico y poco masificado, mientras las medianías y las cumbres ofrecen espacios protegidos como el Monumento Natural del Barranco de Fasnia y Güímar o el Parque Natural de la Corona Forestal.